روش‌های مختلفی برای سازمان‌دهی و مدیریت داده‌های کیفی به کار گرفته‌شده‌اند. قبل از ظهور برنامه‌های کامپیوتری برای مدیریت داده‌های کیفی مرتبط، روند اصلی، ایجاد فایل‌های مفهومی بود. این روش شامل ایجاد یک فایل فیزیکی برای هر طبقه و سپس برش و واردکردن فایل تمامی اطلاعات مرتبط با آن طبقه بود. ایجاد فایل‌های مفهومی به‌طور آشکار کاری دشوار و فشرده هست. روش‌های دستی سنتی سازمان‌دهی داده‌های کیفی دارای سابقه طولانی و معتبر است اما برنامه‌های کامپیوتری پیچیده برای مدیریت داده‌های کیفی اخیر به‌طور گسترده مورداستفاده قرار می‌گیرند این برنامه‌ها به فایل داده‌های کامل اجازه می‌دهند تا وارد کامپیوتر شود و هر بخشی از این مصاحبه یا صدا قابل‌مشاهده و گزارش‌ شود. سپس بخش‌های متناسب با کدهای خاص تحلیل، بازیابی و پرینت شود و یا اینکه روی صفحه نشان داده شود. نسل جدید برنامه‌ها همچنین دارای ویژگی‌هایی می‌باشند که فراتر از دسته‌بندی و بازیابی می‌روند. آن‌ها امکاناتی را برای بررسی واقعی و ترکیب داده‌ها پیشنهاد می‌کند. برنامه‌های کامپیوتری سختی برش و خواندن صفحه به صفحه اسناد را برطرف می‌کند. بعضی از پژوهشگران کیفی به مدیریت داده‌های کامپیوتری روی آورده‌اند. زیرا این کار زمانشان را آزاد می‌کند و به آن‌ها اجازه می‌دهد تا بیشتر به مسائل پنداشتی مهم‌تر توجه کنند.